В сентябре климат в Желтых Водах можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 21 градус тепла. В среднем в сентябре в Желтых Водах 17 ясных, 11 с переменной облачностью и 2 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в августе Желтые Воды cчитается местом, комфортным для посещения.