В июне климат в Заполярном можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 11 градусов тепла. В среднем в июне в Заполярном 15 пасмурных, 10 дождливых, 3 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные.