В июне климат в Заполярном можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 13 градусов тепла. В среднем в июне в Заполярном 13 дождливых, 8 пасмурных, 5 ясных и 4 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные.