В сентябре климат в Янчукане можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 6 градусов тепла. В среднем в сентябре в Янчукане 15 дождливых, 6 с переменной облачностью, 5 ясных, 3 пасмурных и 1 день со снегом. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и мае Янчукан cчитается местом, некомфортным для посещения.