В сентябре климат в Вильгельмсхафене можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 17 градусов тепла. В среднем в сентябре в Вильгельмсхафене 15 дождливых, 7 ясных, 5 с переменной облачностью и 3 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные.