В сентябре климат в Водораздельном можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 17 градусов тепла. В среднем в сентябре в Водораздельном 12 ясных, 10 дождливых, 5 с переменной облачностью и 3 пасмурных дня. Дожди преимущественно сильные.