В сентябре климат в Усть-Шоноше можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Усть-Шоноше 21 дождливый, 8 пасмурных и 1 ясный день. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, апреле и октябре Усть-Шоноша cчитается местом, некомфортным для посещения.