В июне климат в Сторожевой можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 19 градусов тепла. В среднем в июне в Сторожевой 18 дождливых и 12 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, марте, апреле и мае Сторожевая cчитается местом, некомфортным для посещения.