В сентябре климат в Совдозеро можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Совдозеро 17 дождливых, 7 пасмурных, 3 ясных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в апреле и октябре Совдозеро cчитается местом, некомфортным для посещения.