Июнь в Шиллонге — самый пасмурный месяц в году. В июне климат в Шиллонге можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 23 градуса тепла. В среднем в июне в Шиллонге 30 дождливых дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в мае, июле, августе и сентябре Шиллонг cчитается местом, некомфортным для посещения.