В июне климат в Панагии можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 23 градуса тепла. В среднем в июне в Панагии 29 ясных и 1 день с переменной облачностью. В июне, а также в мае, июле, сентябре и октябре Панагия cчитается местом, комфортным для посещения.