В сентябре климат в Новониколаевском можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 19 градусов тепла. В среднем в сентябре в Новониколаевском 17 дней с переменной облачностью, 11 ясных и 2 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в августе Новониколаевский cчитается местом, комфортным для посещения.