В июне климат в Новомалороссийской можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 26 градусов тепла. В среднем в июне в Новомалороссийской 15 ясных, 12 дождливых и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные.