В июне климат в Нижнем Чегеме можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 17 градусов тепла. В среднем в июне в Нижнем Чегеме 22 дождливых и 8 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в марте, апреле и мае Нижний Чегем cчитается местом, некомфортным для посещения.