В июне климат в Нисэкоане можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 16 градусов тепла. В среднем в июне в Нисэкоане 19 дождливых, 5 пасмурных, 4 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в апреле, мае, июле и октябре Нисэкоан cчитается местом, некомфортным для посещения.