В июне климат в Новом Афоне можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 23 градуса тепла. В среднем в июне в Новом Афоне 27 ясных, 2 с переменной облачностью и дождливый день. Дожди преимущественно слабые. В июне, а также в июле и сентябре Новый Афон cчитается местом, комфортным для посещения.