В сентябре климат в Мелнике можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 19 градусов тепла. В среднем в сентябре в Мелнике 13 ясных, 11 дождливых, 3 пасмурных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные.