В сентябре климат в Мегринском можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Мегринском 13 дождливых, 10 с переменной облачностью, 4 пасмурных и 3 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в апреле, октябре и ноябре Мегринский cчитается местом, некомфортным для посещения.