В июне климат в Маноквари можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 25 градусов тепла. В среднем в июне в Маноквари 21 дождливый, 8 пасмурных и 1 ясный день. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, марте и апреле Маноквари cчитается местом, некомфортным для посещения.