В сентябре климат в Магарасе можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 7 градусов тепла. В среднем в сентябре в Магарасе 11 дождливых, 10 пасмурных, 6 ясных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и мае Магарас cчитается местом, некомфортным для посещения.