В июне климат в Кызыл-Покунском сельском поселении можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 17 градусов тепла. В среднем в июне в Кызыл-Покунском сельском поселении 20 дождливых и 10 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в марте, апреле и мае Кызыл-Покунское сельское поселение cчитается местом, некомфортным для посещения.