Июнь в Кумамото — самый пасмурный месяц в году. В июне климат в Кумамото можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 25 градусов тепла. В среднем в июне в Кумамото 23 дождливых, 5 пасмурных и 2 ясных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в июле и августе Кумамото cчитается местом, некомфортным для посещения.