В сентябре климат в Истобном можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 17 градусов тепла. В среднем в сентябре в Истобном 12 дней с переменной облачностью, 8 ясных, 6 пасмурных и 4 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые.