В июне климат в Хакубе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 18 градусов тепла. В среднем в июне в Хакубе 25 дождливых, 3 пасмурных и 2 ясных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в марте, апреле, мае и июле Хакуба cчитается местом, некомфортным для посещения.