В октябре климат во Фленсбурге можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в октябре 12 градусов тепла. В среднем в октябре во Фленсбурге 20 дождливых, 6 пасмурных, 4 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В октябре, а также в январе, феврале, марте и сентябре Фленсбург cчитается местом, некомфортным для посещения.