В сентябре климат в Десногорске можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 16 градусов тепла. В среднем в сентябре в Десногорске 10 дождливых, 10 с переменной облачностью, 6 ясных и 4 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные.