В сентябре климат в Чаган-Узуне можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 7 градусов тепла. В среднем в сентябре в Чаган-Узуне 12 дождливых, 9 ясных и 9 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Чаган-Узун cчитается местом, некомфортным для посещения.