В сентябре климат в Чески Крумлове можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Чески Крумлове 10 дождливых, 9 с переменной облачностью, 8 ясных и 3 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные.