В сентябре климат в Большом Карагае можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Большом Карагае 16 дождливых, 11 пасмурных и 3 ясных дня. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Большой Карагай cчитается местом, некомфортным для посещения.