В сентябре климат в Байкале можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Байкале 11 дождливых, 9 с переменной облачностью, 7 ясных и 3 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные.