В сентябре климат в Верхнем Кугенере можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Верхнем Кугенере 18 дождливых, 8 пасмурных, 3 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, апреле и октябре Верхний Кугенер cчитается местом, некомфортным для посещения.