В сентябре климат в Новотроицке можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Новотроицке 9 дождливых, 9 с переменной облачностью, 8 пасмурных и 4 ясных дня. Дожди преимущественно слабые.