В сентябре климат в Нижнем Бургалтае можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Нижнем Бургалтае 10 ясных, 9 дождливых, 9 с переменной облачностью и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно слабые.