В сентябре климат в Мегино-Алдане можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 8 градусов тепла. В среднем в сентябре в Мегино-Алдане 10 дождливых, 8 с переменной облачностью, 6 ясных и 6 пасмурных дней. Дожди преимущественно умеренные.