Июнь в Мата-ди-Сан-Жуан — самый дождливый и пасмурный месяц в году. В июне климат в Мата-ди-Сан-Жуан можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 26 градусов тепла. В среднем в июне в Мата-ди-Сан-Жуан 24 дождливых, 5 с переменной облачностью и 1 ясный день. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, марте и апреле Мата-ди-Сан-Жуан cчитается местом, некомфортным для посещения.