В сентябре климат в Сельском поселении Кыстатыам можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 5 градусов тепла. В среднем в сентябре в Сельском поселении Кыстатыам 19 пасмурных, 4 ясных, 3 с переменной облачностью, 2 дождливых и 2 дня со снегом. Дожди преимущественно слабые.