В июне климат в Конотопе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 22 градуса тепла. В среднем в июне в Конотопе 15 ясных, 8 дождливых и 7 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно слабые.