В сентябре климат в Джексонвилл Бич можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 28 градусов тепла. В среднем в сентябре в Джексонвилл Бич 19 дождливых, 10 ясных и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в июне, июле и августе Джексонвилл Бич cчитается местом, некомфортным для посещения.