В июне климат в Ыгдыре можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 26 градусов тепла. В среднем в июне в Ыгдыре 28 ясных, 1 дождливый и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно слабые. В июне, а также в сентябре Ыгдыр cчитается местом, комфортным для посещения.