В ноябре климат в Глубока над Влтавой можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в ноябре 6 градусов тепла. В среднем в ноябре в Глубока над Влтавой 10 пасмурных, 9 с переменной облачностью, 8 дождливых и 3 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В ноябре, а также в январе, феврале, марте и апреле Глубока над Влтавой cчитается местом, некомфортным для посещения.