В сентябре климат в Губкинском можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 7 градусов тепла. В среднем в сентябре в Губкинском 18 дождливых, 10 пасмурных и 2 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и мае Губкинский cчитается местом, некомфортным для посещения.