В сентябре климат в Багио можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 22 градуса тепла. В среднем в сентябре в Багио 30 дождливых дней. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в марте, апреле, мае и июне Багио cчитается местом, некомфортным для посещения.