В сентябре климат в Ананиндеуа можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 31 градус тепла. В среднем в сентябре в Ананиндеуа 22 дождливых и 8 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и апреле Ананиндеуа cчитается местом, некомфортным для посещения.