В июне климат в Агинском можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 22 градуса тепла. В среднем в июне в Агинском 14 дней с переменной облачностью, 7 ясных, 6 дождливых и 3 пасмурных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в марте, июле и августе Агинское cчитается местом, комфортным для посещения.